Yayasan Yatim Mandiri merupakan sebuah lembaga sosial masyarakat yang memfokuskan pada penghimpunan dan pengelolaan dana ZISWA (zakat, infaq, shodaqoh dan wakaf) serta dana lainnya yang halal dan legal, dari perorangan, kelompok, perusahaan/ lembaga umat Islam dan menyalurkannya secara lebih profesional dengan menitikberatkan program untuk kemandirian anak yatim sebagai penyaluran program unggulan. Dengan kompleksitas pekerjaan yang ada pada yayasan Yatim Mandiri maka diperlukan sistem komputerisasi salah satunya adalah pada bagian pengelolaan penggajian karyawan. Sampai saat ini yayasan Yatim Mandiri belum memiliki sistem/perangkat lunak yang digunakan untuk membantu dalam pengelolaan penggajian karyawan sehingga membutuhkan waktu yang cukup lama untuk membuat rekap absensi dan penggajian karena masih menggunakan cara konvensional dengan penghitungan secara manual. Sehingga terkadang karyawan mengalami keterlambatan dalam menerima gaji. Tujuan penulisan skripsi ini adalah merancang prototype aplikasi penggajian untuk nantinya bisa dikembangkan menjadi aplikasi yang utuh sehingga dapat digunakan untuk membantu yayasan Yatim Mandiri dalam mengelola data penggajian. Prototype aplikasi penggajian ini dirancang menggunakan bahasa pemrograman PHP dan MySQLi yang dapat dijalankan pada browser.

Kata kunci : Prototype, Penggajian, PHP, MySQLi