Simulasi dinamika molekuler merupakan salah satu metode yang digunakan menganalisa maupun mengamati bagaimana proses difusi atom pada penyambungan logam beda jenis Fe-Ni dalam skala atomik. Yang kemudian menvisualisasikan kedalam bentuk grafik maupun 3D agar mempermudah proses analisisnya . Persamaan hukum newton serta hukum fisika klasik menjadi dasar dari simulasi iniDalam penelitian ini kita menggunakan simulasi dinamika molekuler dimana sebelum melakukan simulasi terlebih dahulu menentukan struktur kristal awal dari sistem tersebut dengan menggunakan avogadro. Pada simulasi ini sistem tersusun dari material Fe dan material Ni yang disusun bertingkat dengan jarak antar muka 2,5 Å .Simulasi terbagi menjadi 3 fase yaitu delta , gamma dan liquid .Pada fase gamma tidak terjadi proses difusi , dikarenakan difusi tidak terjadi pada temperatur yang rendah. Nilai koefisien terendah terjadi pada fase delta di temperatur 1670 K sebesar 4,65 x 10-5 cm2/s pada logam Fe dan 6,23 x 10-5 cm2/s untuk logam Ni dan nilai koefisien tertinggi terjadi pada fase liquid di temperatur 1931 K sebesar 19,95 x 10-5 cm2/s untuk logam Fe dan 21,97 x 10-5 cm2/s pada logam Ni , dengan demikian semakin tinggi temperatur yang digunakan maka semakin tinggi pula nilai koefisien tingginya serta semakin cepat proses difusinya.